Als deutsche Sektion des Dachverbandes Union Europäischer Föderalisten (UEF) kooperiert die Europa-Union mit Partnerorganisationen in über 30 Ländern Europas und arbeitet über das Netzwerk Europäische Bewegung Deutschland (EBD) mit weiteren europäischen Verbänden zusammen, die eine föderative und demokratisch-rechtsstaatliche Vereinigung der europäischen Völker erstreben.
Bislang hat die Europa-Union Deutschland drei Verbände im europäischen Ausland. Im Jahr 2007 gründete sich der Verband Brüssel. Im Juni 2017 kam der Verband Luxemburg hinzu. Im April 2018 gründete sich in Dublin der Verband Irland.